소년원 신입교사 지민은 폭력소년 강준의 작문에서 특별한 재능을 발견한다.

소년원 교사로 취직한 지민은 폭력소년 강준의 글에서 특별한 재능을 발견한다. 소년원에서 느낀 우울과 절망을 내밀하게 기록한 강준의 글을 보며 저도 모르게 눈물짓게 된 지민. 그는 어느덧 강준의 재능을 키워주는 일에 제 진심을 쏟기 시작하고, 그러한 지민의 진심에 강준 역시 조금씩 맘을 열기 시작한다. 그러나 지민이 강준에게 접근한 진짜 이유가 밝혀지며 애정으로 가득했던 둘의 관계는 증오로 치닫는다.

<소년일기>는 소년원생과 접촉하며 그의 내면과 마주하는 한 교사의 이야기이며, 그 교사를 통해 범죄의 세계를 벗어나 예술의 세계를 맛보는 소년원생의 이야기이기도 하다.
자신들을 시험하는 상황 속에서도 두 인물은 끝내 서로를 믿고 지지해 준다. 자신을 믿고 지지해 주는 이가 있을 때 한 사람의 삶은 변할 수도 있다고 이 영화는 말하고자 한다.